Gnome

Time 2020-11-14 07:03:28

Web Name: Gnome

WebSite: http://www.mon-genome.com

ID:115455

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Gnome,

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Le g nome est la totalit du mat riel g n tique d un individu ou d une esp ce encod dans son ADN ( l exception de certains virus dont le g nome est port par des mol cules d ARN). Il contient surtout l ensemble des s quences codantes (traduites en prot ines) et non-codantes (transcrites en ARN, non traduites). Le chercheur fran ais Christian V lot[1] compare le g nome une encyclop die dont les diff rents volumes seraient les chromosomes. Les g nes seraient les phrases contenues dans ces volumes et ces phrases seraient r dig es dans un langage g n tique repr sent par quatre bases (ad nine, guanine, cytosine et thymine) abr g es en AGCT. La science qui tudie le g nome est la g nomique. Les g nomes dans le monde vivantChez les virus, le g nome est contenu soit dans une (ou plusieurs) mol cule (s) d ADN ou d ARN, simple ou double brin. Chez les procaryotes (bact ries et arch es), on distingue le g nome chromosomique, contenu dans une mol cule d ADN le plus souvent circulaire, et le g nome extrachromosomique, contenu dans des plasmides et des pisomes. Chez les eucaryotes, on distingue:le g nome nucl aire, contenu dans le noyau qui caract rise les eucaryotes. C est de ce g nome dont on parle g n ralement lorsque on parle du g nome d un eucaryote (un animal, une plante, un champignon) ;les g nomes non-nucl aires, contenus dans des organites:le g nome mitochondrial, contenu dans les mitochondries, chez la majorit des eucaryotes;le g nome chloroplastique, contenu dans les chloroplastes, chez les plantes et les algues eucaryotes. Chez quelques eucaryotes (par exemple la levure) sont aussi pr sents des plasmides (de taille r duite). Chez l homme surtout (organisme eucaryote), le g nome nucl aire est r parti sur 46 chromosomes, soit 22 paires d autosomes et deux gonosomes. Il ne faut pas confondre le g nome et le caryotype, qui caract rise les chromosomes. Taille du g nomeLa taille du g nome se mesure en nombre de nucl otides, ou bases. La majorit du temps, on parle de pb (pour paire de bases, puisque la majorit des g nomes est constitu e de doubles brins d ADN ou bien d ARN). On emploie fr quemment les multiples kb (pour kilo-base) ou Mb (m ga-base), qui valent respectivement 1000 et 1000000 bases. La taille du g nome peut aussi tre exprim e en pg (pico-grammes), ce qui correspond la masse d ADN (haplo de) par cellule. 1 pg repr sente peu pr s 1000 Mpb (978 Mpb exactement). La taille du g nome peut fluctuer de quelques kilo-bases chez les virus plusieurs centaines de milliers de Mb chez certains eucaryotes. La quantit d ADN, au contraire de ce qui a t longtemps suppos , n est pas proportionnelle la complexit d un organisme; ainsi, l amibe Am ba dubia, un organisme unicellulaire, a un g nome peu pr s 200 fois plus grand que Homo sapiens. Ce constat est souvent nomm paradoxe de la valeur C. Le g nome humain tait estim l g rement plus de 30000 g nes. Cette estimation a t revue la baisse ensuite, et est aujourd hui estim e peu pr s 26000 -27000 - l g rement moins que la plante Arabidopsis thaliana (27000 g nes). La s quence compl te du dernier chromosome dans le g nome humain (chromosome 1, le plus grand, contenant lui seul 8% de ce g nome) a t obtenue en mai 2006. L annotation des g nomesL annotation d un g nome consiste traiter l information brute contenue dans la s quence dans l objectif:de pr dire, le contenu en g nes, la position des g nes l int rieur d un g nome (le d but, la fin, et chez les eucaryotes, les introns et les exons), mais aussi leur organisation (g nes uniques ou en op ron, avec des s quences promotrices, des terminateurs, des sites de fixation ribosomaux (RBS) ). Dans ce cas, on parle d annotation structurale. de pr dire la fonction potentielle de ces g nes (leur attacher une tiquette, portant leur nom probable, leur fonction probable, leurs interactions probables). Dans ce cas on parle d annotation fonctionnelle. Les 2 types d annotationsL annotation peut tre automatique c est- -dire s appuyer seulement sur des algorithmes recherchant des similarit s (de s quence, de structure, de motifs, ), servant pr dire (en fait deviner) la fonction d un g ne. Elle aboutit au transfert automatique de l information figurant dans l tiquette d un g ne semblable d un g nome d j annot au g nome en cours d annotationL annotation automatique est quelquefois compl t e par une annotation manuelle par des experts qui valident ou invalident la pr diction selon leurs connaissances ou de r sultats exp rimentaux. Celle-ci peut ainsi viter le transfert automatique d erreurs et par cons quent leur propagation, ce qui peut devenir le grand probl me que devra confronter la g nomique, compte tenu de l afflux massif de donn es issues surtout, des nouvelles techniques de s quen age (voir pyros quen age). Article d taill : g n tique humaine. Notes et r f rences Ce texte est issu de l'encyclop die Wikipedia. Vous pouvez consulter sa version originale dans cette encyclop die l'adresse http://fr.wikipedia.org/wiki/G%C3%A9nome. Voir la liste des contributeurs.La version pr sent e ici t extraite depuis cette source le 17/09/2009. Ce texte est disponible sous les termes de la licence de documentation libre GNU (GFDL). La liste des d finitions propos es en t te de page est une s lection parmi les r sultats obtenus l'aide de la commande define: de Google. Cette page fait partie du projet Wikibis.

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Le génome est la totalité du matériel génétique d'un individu ou d'une espèce encodé dans son ADN.

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